因为像骨关节炎疾病和大部分的浅表性的软组织炎症都是无菌性炎症疾病，主要是由于组织存在不同程度的微循环障碍，长期的微循环障碍导致水肿加重和组织退变，所以首先的治疗方法不是药物治疗，而且改善血液循环来实现组织消炎、消肿和退变组织的康复治疗手段，因此微波治疗仪由于具有很强的穿透力，能穿透到人体组织3-5厘米的深度，这是其它常见治疗手段所不能实现的，因为微波治疗仪的发展前景非常好，主要是可以给数以亿计的炎症患者带来实实在在的康复机会，所以微波治疗仪进入家庭的前景非常好。
微波治疗仪属于热疗仪，和红外线治疗仪是通过促进血液血液循环来促进炎症吸收和改善对细胞的营养供给，区别于其它热疗仪，微波最大的特点是具有比红外线强得多的穿透能力，由于微波治疗仪采用的理疗因子其电磁波的波长是122.4毫米，远远大于红外线最大1毫米的波长，所以微波能直接穿透人体组织深度达5-6公分，
因此微波治疗时不用脱出衣物，骨折患者可以直接在石膏板外边直接照射。通过微波照 射能直接产生以下微波热效应和微波生物学效应：
 （1）微波热效应
将波长为12公分的电磁波通过微波理疗头照射到人体组织时，能直接引起人体组织5-6公分深度内的水分子高速旋转和振荡，从而引起该组织的温度上升，由于温度上升后，人体组织内的毛细血管扩张，使血液能轻松灌注到人体该组织，使组织细胞的营养供给大大改善。治疗时有非常明显的温热舒适感就是微波的热效应的体现。
（微波穿透膝关节示意图）
（2）微波生物学效应
在微波热效应的基础上，由于血液循环的改善，人体细胞能得到充分的营养物质供应，使细胞的新陈代谢大大加强，因此促进了细胞功能和形态的恢复，同时促进新肉芽的生长，微波已经被广泛地运用于外科手术后伤口的愈合的理疗上；同时，由于血液循环的改善，使大量的具有免疫功能的物质能充分到达炎症组织，使代谢产生的影响细胞正常生命活动的物质得到有效清除，恢复了人体局部组织的细胞环境，调节了局部的酸碱失衡，所以微波治疗仪具有消炎、消肿和除痛的疗效。

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